Сюита милых лекарств: Возвращение! Мелодия чуда соединения сердец

После победы в миссии Лекарство Вдохновления и восстановлении доброго сердца её отца, Ако [調辺アコ] и Мефисто [メフィスト] решили вернуться в Большие Земли вместе. Внезапно сильный шум разнёсся по городу и, когда он утих, вся музыка бесследно исчезла. Ако и Мефисто пытались установить контакт с Большой Землёй, но не смогли получить ответа. Полные тревоги Хибики [北条響] и другие девушки направились в Большие Земли, ранее переполненные музыкой. Мир опустел без звука. Люди, лишённые эмоций, как каменные, продолжали играть на своих беззвучных инструментах. Только одна Судзу, подруга Ако, объяснила, что Афродита [アフロディテ] неожиданно изменилась и забрала всю музыку. Ако и Мефисто, не верящие в это и решившие узнать правду, направились к дворцу Афродиты. Хибики, Канаде [南野奏] и Эллен [Siren] решили преследовать Судзу, которая сбежала после того, как Ако отказалась верить в её историю. Во время погони за Судзу, девушки встретились с тремя мужчинами, которые хотят украсть Сундук Исцеления.
Постепенно истина выходит на свет, и Милые Лекарства сталкиваются с настоящим врагом.